AmpLyze est un nouveau modèle qui prédit la valeur hémolytique 50 (HC50) des peptides antimicrobiens (PAM) en se basant uniquement sur les informations de séquence et en tenant compte des résidus hémotoxiques. Contrairement aux modèles existants qui classent simplement les PAM comme « toxiques » ou « non toxiques », AmpLyze prédit quantitativement les valeurs réelles de HC50. Il combine les inclusions ProtT5/ESM2 au niveau des résidus avec des descripteurs au niveau des séquences pour construire des branches locales et globales, les aligne via un module d'attention croisée et les entraîne à l'aide d'une fonction de perte log-cosh. Le modèle AmpLyze optimisé atteint un PCC de 0,756 et une MSE de 0,987, surpassant ainsi les modèles de régression existants et les modèles de pointe. Les expériences d'ablation démontrent que les deux branches sont essentielles, l'attention croisée apportant des améliorations de performance supplémentaires. L'attribution par gradients attendus identifie les points chauds de toxicité connus et suggère des substitutions plus sûres. AmpLyze accélère la conception de l'AMP en convertissant les évaluations d'hémolyse en prédictions quantitatives, basées sur la séquence et interprétables, fournissant un outil pratique pour le dépistage précoce de la toxicité.
