OT-MESH est un cadre de calcul non supervisé qui utilise le transport optimal régulé par l'entropie (OT) pour déterminer systématiquement les homologies évolutives des types cellulaires entre espèces. Pour surmonter les limites des méthodes conventionnelles d'appariement basées sur les références ou les projections, OT-MESH améliore le schéma OT en intégrant la technique de minimisation de l'entropie de Sinkhorn (MESH), transformant les matrices de transport par diffusion en correspondances clairsemées interprétables. Les évaluations sur des ensembles de données synthétiques démontrent une grande précision, une efficacité de calcul et une robustesse au bruit. Comparé à d'autres méthodes basées sur l'OT, telles que RefCM, OT-MESH atteint une précision comparable avec une vitesse améliorée. Les applications aux cellules bipolaires (BC) et aux cellules ganglionnaires rétiniennes (RGC) de souris et de macaque permettent de retrouver avec précision les relations évolutives connues et de découvrir de nouvelles correspondances, dont l'une est validée par des expériences indépendantes. Ainsi, OT-MESH fournit une solution de cartographie évolutive des types de cellules basée sur des principes, évolutive et interprétable qui fournit des informations approfondies sur la spécialisation et la conservation des cellules à travers les espèces.
