OT-MESHは、種間細胞型の進化的相同性を体系的に決定するためにエントロピー規制最適輸送(OT)を利用する非マップ計算フレームワークです。既存の参照ベースマッチングや投影ベースマッチング方式の限界を克服するために、Minimize Entropy of Sinkhorn(MESH)技術を統合してOT計画を改善することによって、拡散輸送行列を解釈可能なスパース対応に変換します。合成データセットを使用した評価では、OT-MESHは高い精度と計算効率、およびノイズに対する堅牢性を示しました。 RefCMのような他のOTベースの方法と比較して、速度向上と同等の精度を達成した。マウスとマカクの網膜陽極細胞(BC)と網膜神経節細胞(RGC)に適用して、既知の進化的関係を正確に修復し、新しい対応関係を発見し、そのうちの1つは独立した実験で検証されました。したがって、OT-MESHは、種間細胞の特殊化と保存に関する深い洞察を提供する原則的で拡張可能であり、解釈可能な進化細胞型マッピングソリューションを提供します。