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Flow Matching Meets Biology and Life Science: A Survey

Created by
  • Haebom

作者

Zihao Li, Zhichen Zeng, Xiao Lin, Feihao Fang, Yanru Qu, Zhe Xu, Zhining Liu, Xuying Ning, Tianxin Wei, Ge Liu, Hanghang Tong, Jingrui He

概要

本論文は、フローマッチングベースの生成モデリングの生物学的応用の最初の包括的な調査論文です。生成的敵対ニューラルネットワーク、マスク磁気エンコーダ、拡散モデルなどの生成モデルの進歩が生物学的研究に革新をもたらした中で、フローマッチングは拡散ベースモデルの強力で効率的な代替として浮上しています。本論文はフローマッチングの基本と変形を体系的に検討し,生物学的配列モデリング,分子生成と設計,ペプチドとタンパク質生成の3つの主要領域に応用事例を分類し,最近の進展状況を深く検討する。また、一般的に使用されるデータセットとソフトウェアツールを要約し、今後の研究の方向性についての議論を提示します。関連資料はhttps://github.com/Violet24K/Awesome-Flow-Matching-Meets-Biologyで確認できます。

Takeaways、Limitations

Takeaways:フローマッチングベースの生成モデリングの生物学的応用の最初の包括的な調査を提供し、その分野の研究動向を特定し、将来の研究方向を提示します。生物学的配列モデリング、分子生成および設計、ペプチドおよびタンパク質生成など、様々な分野におけるフローマッチングの適用可能性を示す。関連データセットとソフトウェアツールに関する情報を提供します。
Limitations:この論文は2025年7月時点の研究動向に基づいて作成されたので、それ以降の研究結果は反映されていない可能性があります。
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