[공지사항]을 빙자한 안부와 근황 
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Assay2Mol: large language model-based drug design using BioAssay context

Created by
  • Haebom

저자

Yifan Deng, Spencer S. Ericksen, Anthony Gitter

개요

Assay2Mol은 생화학적 스크리닝 분석의 비정형 텍스트 데이터를 활용하여 새로운 약물 발견을 위한 후보 분자를 생성하는 대규모 언어 모델 기반 워크플로우입니다. 기존의 표적 단백질 구조를 기반으로 하는 머신러닝 접근 방식보다 성능이 우수하며, 합성 가능한 분자 생성을 향상시킵니다. 유사한 표적을 포함하는 기존 분석 기록을 검색하고, 검색된 분석 스크리닝 데이터를 사용하여 문맥 내 학습을 통해 후보 분자를 생성합니다. 방대한 양의 정량적 데이터와 함께 기술적 텍스트를 포함하는 과학 데이터베이스를 활용하여 초기 단계 약물 발견을 지원합니다.

시사점, 한계점

시사점:
생화학적 스크리닝 분석의 비정형 텍스트 데이터를 활용하여 신약 개발을 가속화할 수 있는 가능성을 제시합니다.
기존 머신러닝 방식보다 성능이 우수하고 합성 가능성이 높은 후보 분자를 생성합니다.
초기 단계 약물 발견 과정에 효율성을 높일 수 있습니다.
한계점:
논문에서는 구체적인 한계점이 언급되지 않았습니다. 모델의 성능 평가 지표 및 데이터셋의 규모, 일반화 성능, 실제 약물 개발 과정에서의 적용 가능성 등에 대한 추가적인 연구가 필요할 것으로 예상됩니다.
특정 표적에 대한 데이터 부족으로 인한 성능 저하 가능성이 존재할 수 있습니다.
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