本論文では、グラフ構造データを活用した確率的グラフモデル(PGM)とグラフニューラルネットワーク(GNN)の性能をリンク予測操作で比較分析します。合成および実際のネットワークデータセットで3つの主要な実験を行い、入力特性の処理、雑音特性の堅牢性、およびグラフの不均一性の増加に伴う性能の変化を比較分析しました。特に、ノードの特徴が低次元であるかノイズが多い場合、グラフの異種性が高くなると、PGMはGNNよりも優れた性能を示すことが確認された。さらに、予測作業に加えて、計算の複雑さと解釈可能性の観点から、2つのフレームワークを比較分析しました。