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Scalable Non-Equivariant 3D Molecule Generation via Rotational Alignment

Created by
  • Haebom

作者

Yuhui Ding, Thomas Hofmann

概要

本論文は、3D分子生成において優れた性能を示す等辺拡散モデルのスケーラビリティと効率の限界を解決する新しい方法を提示します。従来の等辺拡散モデルは、SE(3) - 等辺デノイジングネットワークを使用して3D分子のユークリッド対称性を考慮していますが、特殊な等辺アーキテクチャは拡張性と効率を制限します。本稿では、分子ごとにサンプル依存のSO(3)変換を学習して、整列された潜在空間を構築するアプローチを提案します。次に、ソートされた表現のための沸騰辺拡散モデルを訓練します。実験結果によれば、提案された方法は、従来の沸騰辺モデルよりもはるかに優れた性能を示し、最先端の等辺拡散モデルと比較するのに十分なサンプル品質を提供しながら、トレーニングおよびサンプリング効率を向上させる。コードはhttps://github.com/skeletondyh/RADMで利用可能です。

Takeaways、Limitations

Takeaways:
沸騰辺拡散モデルを用いた等辺モデルレベルの性能達成
等辺モデルと比較して改善されたトレーニングとサンプリング効率を提供
3D分子生成におけるスケーラビリティと効率の問題解決に対する新しいアプローチの提示
Limitations:
提案された方法の一般性と他の種類のデータへの適用性に関するさらなる研究が必要
SO(3)変換学習プロセスの複雑さと計算コストの分析が必要
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