Pediatric brain tumor classification using digital histopathology and deep learning: evaluation of SOTA methods on a multi-center Swedish cohort
Created by
Haebom
作者
Iulian Emil Tampu, Per Nyman, Christoforos Spyretos, Ida Blystad, Alia Shamikh, Gabriela Prochazka, Teresita D iaz de St{\aa}hl, Johanna Sandgren, Peter Lundberg, Neda Haj-Hosseini
概要
本研究では、小児脳腫瘍診断のための計算病理法の可能性を評価するために、スウェーデンの6つの大学病院の多施設コホートで収集された540人の小児患者(平均年齢8.5歳)の脳腫瘍組織スライド画像(WSI)を使用して弱く監督されるマルチインスタンス学習(MIL)方法を実施しました。 ResNet50、UNI、CONCH 3つの事前訓練された特徴抽出器を使用してWSIからパッチレベルの特徴を抽出し、ABMILまたはCLAMを使用して患者レベルの分類のための特徴を集計しました。小児脳腫瘍の階層的分類に基づき,種類,系列,型の3つの分類作業についてモデルを評価した。 UNI 特徴と ABMIL 集計を使用した場合、最も高い分類性能を示し、種類、系列、型分類の Matthew 相関係数はそれぞれ 0.76±0.04、0.63±0.04、0.60±0.05 でした。 UNI および CONCH 機能を使用したモデルは、ResNet50 を使用したモデルよりも一般化性能が優れていました。