본 논문은 생물의학 연구 과정 전반을 자동화하는 최초의 엔드-투-엔드 시스템인 BioResearcher를 소개합니다. 기존의 생물의학 연구는 방대한 문헌과 데이터셋으로 인해 노동 집약적이지만, BioResearcher는 검색, 문헌 처리, 실험 설계, 프로그래밍을 위한 특수 에이전트를 통합한 모듈형 다중 에이전트 아키텍처를 사용하여 이 문제를 해결합니다. 계층적 학습 방식을 통해 다학제적 요구사항과 논리적 복잡성에 효과적으로 대처하며, LLM 기반 검토자를 통한 품질 관리와 새로운 평가 지표를 도입하여 실험 프로토콜의 품질과 자동화 수준을 평가합니다. BioResearcher는 8개의 이전에 달성되지 못한 연구 목표에서 평균 63.07%의 실행 성공률을 달성했으며, 생성된 프로토콜은 5가지 품질 지표에서 일반적인 에이전트 시스템보다 평균 22.0% 더 나은 성능을 보였습니다. 이는 연구자의 업무량을 줄이고 생물의학 발견을 가속화할 수 있는 잠재력을 보여줍니다.