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Assay2Mol: diseño de fármacos basado en un modelo de lenguaje extenso utilizando el contexto de BioAssay

Created by
  • Haebom

Autor

Yifan Deng, Spencer S. Ericksen, Anthony Gitter

Describir

Assay2Mol es un flujo de trabajo a gran escala basado en modelos de lenguaje que aprovecha datos de texto no estructurado de ensayos de cribado bioquímico para generar moléculas candidatas para el descubrimiento de nuevos fármacos. Supera los enfoques tradicionales de aprendizaje automático basados en la estructura de proteínas diana y mejora la generación de moléculas sintetizables. Busca registros de ensayos existentes que contengan dianas similares y utiliza los datos de cribado recuperados para generar moléculas candidatas mediante aprendizaje contextual. Aprovecha bases de datos científicas que contienen texto técnico, junto con grandes cantidades de datos cuantitativos, para apoyar el descubrimiento de fármacos en las primeras etapas.

Takeaways, Limitations

Takeaways:
Presentamos el potencial de acelerar el descubrimiento de fármacos aprovechando datos de texto no estructurados de ensayos de detección bioquímica.
Genera moléculas candidatas que superan los enfoques de aprendizaje automático existentes y tienen alta capacidad de sintetización.
Puede aumentar la eficiencia en el proceso de descubrimiento de fármacos en etapa temprana.
Limitations:
El artículo no menciona específicamente Limitations. Se prevé que se requiera investigación adicional sobre las métricas de evaluación del rendimiento del modelo, el tamaño del conjunto de datos, el rendimiento de generalización y la aplicabilidad en el proceso real de desarrollo de fármacos.
Puede existir la posibilidad de una degradación del rendimiento debido a la falta de datos para objetivos específicos.
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