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Reaction Prediction via Interaction Modeling of Symmetric Difference Shingle Sets

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저자

Runhan Shi, Letian Chen, Gufeng Yu, Yang Yang

ReaDISH: 반응 예측 모델

개요

본 논문은 유기 화학 분야의 주요 과제인 화학 반응 예측에서 기존 기계 학습 모델의 한계점을 해결하기 위해 개발된 ReaDISH 모델을 제시합니다. 기존 모델의 문제점인 입력 순열 민감성 및 반응성을 지배하는 하위 구조적 상호 작용의 부적절한 모델링 문제를 해결하고자, 순열 불변 표현 학습과 상호 작용 인식 기능을 통합했습니다. ReaDISH는 두 가지 혁신적인 기술을 도입합니다: (1) 셔플을 연속 고차원 임베딩으로 표현하는 symmetric difference shingle encoding을 통해 구조적 변화를 포착하고 순서 민감성을 제거하는 differential reaction fingerprint (DRFP) 확장, (2) shingle 수준에서 분자 내 및 분자 간 상호 작용을 모델링하는 geometry-structure interaction attention. 광범위한 실험을 통해 ReaDISH가 다양한 벤치마크에서 반응 예측 성능을 향상시키는 것을 입증했습니다.

시사점, 한계점

시사점:
입력 순열에 강건한 반응 예측 모델 개발
상호 작용을 고려한 모델링을 통해 실제 반응 예측 성능 향상
다양한 벤치마크에서 기존 모델 대비 우수한 성능 입증
permutation perturbation 환경에서 R$^2$ 평균 8.76% 향상
한계점:
논문에 제시된 구체적인 한계점에 대한 정보는 없음.
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