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Leveraging Foundation Models for Histological Grading in Cutaneous Squamous Cell Carcinoma using PathFMTools

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저자

Abdul Rahman Diab, Emily E. Karn, Renchin Wu, Emily S. Ruiz, William Lotter

개요

PathFMTools는 병리 기초 모델의 효율적인 실행, 분석 및 시각화를 가능하게 하는 가볍고 확장 가능한 Python 패키지입니다. 이 도구를 사용하여 피부 편평 세포 암종(cSCC)의 조직학적 등급 분류 작업에 대해 CONCH 및 MUSK와 같은 최첨단 비전-언어 기초 모델을 평가합니다. 440개의 cSCC H&E WSI를 사용하여 여러 적응 전략을 벤치마킹하고, 기초 모델 임베딩을 사용하여 소규모 전문 모델을 훈련할 수 있는 가능성을 입증합니다.

시사점, 한계점

PathFMTools는 병리 기초 모델의 효율적인 실행, 분석 및 시각화를 제공합니다.
CONCH 및 MUSK와 같은 비전-언어 기초 모델을 cSCC 조직학적 등급 분류 작업에 적용합니다.
다양한 적응 전략의 벤치마킹을 통해 예측 접근 방식의 trade-off를 보여줍니다.
기초 모델 임베딩을 활용한 소규모 전문 모델 훈련 가능성을 제시합니다.
WSI 처리의 복잡성, 학습된 특징의 불투명성, 다양한 적응 전략의 존재는 여전히 과제입니다.
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