Leveraging Foundation Models for Histological Grading in Cutaneous Squamous Cell Carcinoma using PathFMTools
Created by
Haebom
Category
Empty
저자
Abdul Rahman Diab, Emily E. Karn, Renchin Wu, Emily S. Ruiz, William Lotter
개요
PathFMTools는 병리 기초 모델의 효율적인 실행, 분석 및 시각화를 가능하게 하는 가볍고 확장 가능한 Python 패키지입니다. 이 도구를 사용하여 피부 편평 세포 암종(cSCC)의 조직학적 등급 분류 작업에 대해 CONCH 및 MUSK와 같은 최첨단 비전-언어 기초 모델을 평가합니다. 440개의 cSCC H&E WSI를 사용하여 여러 적응 전략을 벤치마킹하고, 기초 모델 임베딩을 사용하여 소규모 전문 모델을 훈련할 수 있는 가능성을 입증합니다.
시사점, 한계점
•
PathFMTools는 병리 기초 모델의 효율적인 실행, 분석 및 시각화를 제공합니다.
•
CONCH 및 MUSK와 같은 비전-언어 기초 모델을 cSCC 조직학적 등급 분류 작업에 적용합니다.
•
다양한 적응 전략의 벤치마킹을 통해 예측 접근 방식의 trade-off를 보여줍니다.
•
기초 모델 임베딩을 활용한 소규모 전문 모델 훈련 가능성을 제시합니다.
•
WSI 처리의 복잡성, 학습된 특징의 불투명성, 다양한 적응 전략의 존재는 여전히 과제입니다.