Apo2Mol: 3D Molecule Generation via Dynamic Pocket-Aware Diffusion Models
Created by
Haebom
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저자
Xinzhe Zheng, Shiyu Jiang, Gustavo Seabra, Chenglong Li, Yanjun Li
개요
Apo2Mol은 단백질 결합 포켓의 구조적 유연성을 고려하여 3D 분자를 설계하는 확산 기반 생성 모델 프레임워크입니다. Apo-holo 구조 쌍 데이터셋을 활용하여 단백질 구조 변화를 특징화하고, 3D 분자와 해당 holo 포켓 구조를 동시에 생성합니다. 이를 통해 고친화성 리간드 생성 및 단백질 포켓의 현실적인 구조 변화를 정확하게 포착합니다.