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Artificial Intelligence and Deep Learning Algorithms for Epigenetic Sequence Analysis: A Review for Epigeneticists and AI Experts

Created by
  • Haebom

저자

Muhammad Tahir, Mahboobeh Norouzi, Shehroz S. Khan, James R. Davie, Soichiro Yamanaka, Ahmed Ashraf

개요

본 논문은 후성유전체 데이터를 활용한 AI 모델 연구에 대한 서술적 검토를 제공합니다. 후성유전체는 유전자 서열 변화 없이 유전자 발현을 변화시키는 메커니즘을 포함하며, 암이나 선천적 기형과 같은 다양한 질병 및 장애의 원인이 될 수 있습니다. 기존의 실험적 접근 방식의 시간 및 비용 문제를 해결하기 위해, 머신러닝과 AI가 질병 마커 예측, 유전자 발현, 인핸서-프로모터 상호작용, 크로마틴 상태 등 다양한 문제 해결에 활용되고 있습니다. 본 논문은 AI 전문가와 후성유전학자 모두를 위해 AI 기반 접근법의 이점을 가진 후성유전체 연구 문제의 분류와 각 문제에 대한 후보 AI 솔루션 목록을 제공하며, 문헌의 격차, 연구 과제 및 이러한 과제를 해결하기 위한 권장 사항도 제시합니다.

시사점, 한계점

시사점:
AI를 활용한 후성유전체 연구의 다양한 활용 사례를 제시하여 AI 전문가와 후성유전학자 간의 협력을 촉진합니다.
시간 및 비용이 많이 드는 기존의 실험적 방법의 한계를 극복할 수 있는 AI 기반 대안을 제시합니다.
후성유전체 연구에서 AI의 적용 가능성을 탐색하고, 향후 연구 방향을 제시합니다.
후성유전체 연구 문제에 대한 AI 솔루션의 종합적인 목록을 제공합니다.
한계점:
본 논문은 서술적 검토이므로, AI 모델의 성능이나 정확도에 대한 정량적인 분석이 부족할 수 있습니다.
문헌의 격차 및 연구 과제를 제시하지만, 구체적인 해결 방안에 대한 자세한 논의는 부족할 수 있습니다.
특정 AI 모델에 대한 심층적인 분석보다는 광범위한 개요에 초점을 맞추고 있습니다.
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