본 논문은 방사선 이미지를 기반으로 진단 보고서를 자동 생성하는 Radiology Report Generation (RRG) 분야에서, 기존의 Supervised Fine-Tuning (SFT) 방식의 한계를 극복하고 해부학적 기반 정렬을 확립하는 새로운 SFT 패러다임인 \textsc{S2D-Align}을 제안합니다. \textsc{S2D-Align}은 다양한 세분성의 보조 신호를 활용하여 점진적으로 정렬 과정을 개선하는 shallow-to-deep 전략을 사용하며, 메모리 기반 어댑터를 통해 여러 정렬 단계를 연결합니다. \textsc{MIMIC-CXR} 및 \textsc{IU X-Ray} 벤치마크에서 기존 방법들을 능가하는 성능을 보이며, 다단계, 보조 유도 접근 방식의 효과를 입증합니다.