CORE - A Cell-Level Coarse-to-Fine Image Registration Engine for Multi-stain Image Alignment
Created by
Haebom
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저자
Esha Sadia Nasir, Behnaz Elhaminia, Mark Eastwood, Catherine King, Owen Cain, Lorraine Harper, Paul Moss, Dimitrios Chanouzas, David Snead, Nasir Rajpoot, Adam Shephard, Shan E Ahmed Raza
개요
다양한 다중 모드 전체 슬라이드 이미지(WSI) 데이터셋에서 정확한 핵 수준 등록을 위해 새로운 coarse-to-fine 프레임워크 CORE을 제안합니다. 이 프레임워크는 프롬프트 기반 조직 마스크 추출을 통한 거친 등록, 사전 학습된 특징 추출기를 사용한 가속 밀집 특징 매칭을 통한 전역 정렬, 모양 인식 점 집합 등록 모델을 사용한 세밀한 강체 등록, Coherent Point Drift(CPD)를 사용한 비선형 변위장 추정을 통한 세포 수준의 비강체 정렬을 포함합니다. 제안된 모델은 세 개의 공개 WSI 등록 데이터셋과 두 개의 개인 데이터셋에서 평가되었으며, 밝은 시야 및 면역 형광 현미경 WSI에서 현재 state-of-the-art 방법보다 성능이 우수함을 입증했습니다.
시사점, 한계점
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시사점:
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다중 모드 WSI 데이터셋에서 정확하고 효율적인 핵 수준 등록을 달성합니다.
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bright-field 및 면역 형광 현미경 WSI에서 기존 방법보다 우수한 성능을 보입니다.
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자동으로 생성된 핵을 사용하여 변형 등록의 정확성을 향상시키고, 정확한 핵 수준 일치를 보장합니다.
