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Retrieval Augmented Diffusion Model for Structure-informed Antibody Design and Optimization

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저자

Zichen Wang, Yaokun Ji, Jianing Tian, Shuangjia Zheng

RADAb: Retrieval-Augmented Diffusion Framework for Antibody Design

개요

본 논문은 항체 설계 효율성을 높이기 위해 구조적 상동 모티프를 활용하는 검색 증강 확산 프레임워크인 RADAb를 제안한다. RADAb는 원하는 설계 기준에 따라 항체를 역 최적화하기 위해 질의 구조적 제약 조건에 맞는 일련의 구조적 상동 모티프를 활용한다. 구조적 및 진화 정보를 모두 활용하는 이중 분기 노이즈 제거 모듈을 통해 입력 백본과 모티프를 통합하는 구조 기반 검색 메커니즘을 도입했다. 또한, 전역 컨텍스트와 국소 진화 조건을 모두 통합하여 반복적으로 최적화 프로세스를 개선하는 조건부 확산 모델을 개발했다.

시사점, 한계점

항체 역학 설계 및 최적화 작업에서 SOTA 성능 달성
생성 모델 선택에 제한을 받지 않는 유연성
모델 최적화 문제와 부자연스러운 시퀀스 문제를 해결
구체적인 한계점은 논문에 명시되지 않음
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