जीएलप्रोटीन वैश्विक प्रोटीन लर्निंग का पहला फ्रेमवर्क है, जो वैश्विक संरचनात्मक समानता और स्थानीय अमीनो एसिड जानकारी, दोनों को एकीकृत करके पूर्वानुमान सटीकता और कार्यात्मक अंतर्दृष्टि में सुधार करता है। पारंपरिक प्रोटीन अनुक्रम विश्लेषण के अलावा, यह न केवल त्रि-आयामी संरचनात्मक जानकारी, बल्कि अमीनो एसिड आणविक स्तर पर स्थानीय जानकारी और प्रोटीन-प्रोटीन संरचनात्मक समानता जैसी वैश्विक जानकारी का भी लाभ उठाता है। मास्क्ड प्रोटीन मॉडलिंग, ट्रिपलेट संरचनात्मक समानता स्कोरिंग, त्रि-आयामी दूरी एन्कोडिंग, और उप-संरचना-आधारित अमीनो एसिड आणविक एन्कोडिंग को अभिनव रूप से संयोजित करके, यह प्रोटीन-प्रोटीन अंतःक्रिया पूर्वानुमान और संपर्क पूर्वानुमान सहित विभिन्न जैव सूचना विज्ञान कार्यों में मौजूदा विधियों से बेहतर प्रदर्शन करता है।