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प्रसार मॉडल का उपयोग करके संरचना-निर्देशित PMHC-I लाइब्रेरी का निर्माण
Created by
Haebom
लेखक
सर्जियो मारेस, एरियल एस्पिनोज़ा वेनबर्गर, निला एम. इयोनिडिस
रूपरेखा
प्रभावी प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया उत्पन्न करने में सक्षम पेप्टाइड-एमएचसी वर्ग I (pMHC-I) अंतःक्रियाओं की पहचान पर निर्भर करने वाले व्यक्तिगत टीकों और टी-कोशिका प्रतिरक्षा चिकित्साओं की सीमाओं को संबोधित करने के लिए, यह पत्र एक विसरण मॉडल का उपयोग करके क्रिस्टल संरचना अंतःक्रिया दूरियों के आधार पर डिज़ाइन किए गए pMHC-I पेप्टाइड्स का एक संरचना-आधारित बेंचमार्क प्रस्तुत करता है। यह बेंचमार्क, जिसमें 20 प्राथमिकता वाले HLA एलील शामिल हैं और जो पहले से चिह्नित पेप्टाइड्स से स्वतंत्र है, कैनोनिकल एंकर अवशेष संकेतन को पुन: प्रस्तुत करके प्रयोगात्मक डेटासेट पूर्वाग्रह के बिना संरचनात्मक सामान्यीकरण को प्रदर्शित करता है। इस संसाधन का उपयोग करके, हम प्रदर्शित करते हैं कि अत्याधुनिक अनुक्रम-आधारित भविष्यवक्ता इन संरचनात्मक रूप से स्थिर डिज़ाइनों के लिए बंधन क्षमता को पहचानने में कमज़ोर प्रदर्शन करते हैं ,
