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SCORPION:解决扫描仪引起的组织病理学变异

Created by
  • Haebom

作者

Jeongun Ryu、Heon Song、Seungeun Lee、Soo Ick Cho、Jiwon Shin、Kunghyun Paeng、Sergio Pereira

大纲

本文探讨了由于数字扫描仪的差异而导致的全切片图像 (WSI) 变异性问题,这对于确保计算病理学中跨领域的模型性能可靠至关重要。具体而言,我们强调了扫描仪泛化的重要性,这确保了模型在现实世界中不受扫描仪依赖性的影响,因为现实世界中扫描设备可能因机构和医院而异。与以往主要关注标准领域泛化设置的研究不同,本文提出了 SCORPION,这是一个专门用于评估扫描仪变异性下模型可靠性的全新数据集。SCORPION 包含 2,400 个空间对齐的、由五台扫描仪扫描的 480 个组织样本的图块,它隔离了扫描仪之间的变异性以控制组织成分的差异,同时严格评估了模型的一致性。此外,我们提出了 SimCons,这是一个灵活的框架,它通过将基于增强的领域泛化技术与一致性损失相结合,明确地解决了扫描仪泛化问题。实验结果表明,SimCons 能够在不影响特定任务性能的情况下,提高模型在不同扫描仪之间的一致性。通过发布 SCORPION 数据集和 SimCons 框架,我们为研究界提供了宝贵的资源,用于评估和改进各种扫描仪的模型一致性,并为可靠性测试设定了新的标准。

Takeaways, Limitations

Takeaways:
我们提出了一个新的数据集 SCORPION 和一个框架 SimCons,用于评估考虑扫描仪变异性的计算病理学模型的可靠性。
SimCons 的性能验证,有效解决扫描仪泛化问题。
有助于提高模型可靠性并增加计算病理学领域的实际适用性。
提出评估不同扫描仪模型一致性的新标准。
Limitations:
SCORPION 数据集中样本数量和扫描仪类型的限制。
需要进一步研究来确定 SimCons 的泛化性能是否可以保持用于其他类型的扫描仪或组织。
需要进一步验证 SimCons 在实际临床环境中的实用性。
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