दैनिक अर्क्सिव

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सुपर-रिज़ॉल्यूशन स्थानिक प्रोटिओमिक्स भविष्यवाणी के लिए तंत्रिका प्रोटिओमिक्स क्षेत्र

Created by
  • Haebom

लेखक

बोकाई झाओ, वेयांग शि, हानकिंग चाओ, ज़िजियांग यांग, यियांग झांग, मिंग सॉन्ग, तियानज़ी जियांग

रूपरेखा

यह शोधपत्र अनुक्रमण-आधारित स्थानिक प्रोटिओमिक्स (Seq-SP) में स्थानिक सुपर-रिज़ॉल्यूशन की एक नई चुनौती प्रस्तुत करता है और इस कार्य के लिए पहला गहन शिक्षण मॉडल, न्यूरल प्रोटिओमिक्स फ़ील्ड्स (NPF) प्रस्तावित करता है। NPF ऊतक-विशिष्ट नेटवर्कों को प्रशिक्षित करके seq-SP को सतत अंतरिक्ष में एक प्रोटीन पुनर्निर्माण समस्या के रूप में औपचारिक रूप देता है। इसमें एक स्थानिक मॉडलिंग मॉड्यूल शामिल है जो ऊतक-विशिष्ट प्रोटीन स्थानिक वितरण सीखता है और एक रूपात्मक मॉडलिंग मॉड्यूल जो ऊतक-विशिष्ट रूपात्मक विशेषताओं को निकालता है। इसके अलावा, कठोर मूल्यांकन को सुगम बनाने के लिए, हमने इस कार्य के लिए एक ओपन-सोर्स बेंचमार्क डेटासेट, स्यूडो-विज़ियम SP, बनाया है। प्रायोगिक परिणाम दर्शाते हैं कि NPF कम सीखने योग्य मापदंडों के साथ अत्याधुनिक प्रदर्शन प्राप्त करता है, जो स्थानिक प्रोटिओमिक्स अनुसंधान को आगे बढ़ाने की इसकी क्षमता को उजागर करता है। कोड और डेटासेट सार्वजनिक रूप से उपलब्ध हैं।

Takeaways, Limitations

Takeaways:
अनुक्रमण-आधारित स्थानिक प्रोटिओमिक्स में बेहतर स्थानिक संकल्प में योगदान देने वाले एक नए गहन शिक्षण मॉडल, एनपीएफ का प्रस्ताव।
ऊतक-विशिष्ट विशेषताओं पर विचार करके मॉडल प्रदर्शन में सुधार करना।
भावी अनुसंधान को प्रोत्साहित करने के लिए ओपन-सोर्स बेंचमार्क डेटासेट स्यूडो-विज़ियम एसपी प्रदान करना।
कम मापदंडों के साथ अत्याधुनिक प्रदर्शन प्राप्त करना।
Limitations:
वर्तमान में, इसका मूल्यांकन स्यूडो-विज़ियम एसपी नामक सिंथेटिक डेटासेट का उपयोग करके किया गया है, इसलिए वास्तविक डेटासेट का उपयोग करके आगे सत्यापन की आवश्यकता है।
विभिन्न संगठनात्मक प्रकारों के लिए सामान्यीकरण निष्पादन मूल्यांकन की आवश्यकता होती है।
मॉडल की व्याख्यात्मकता में सुधार करने तथा जैविक तंत्र के साथ इसके संबंध का विश्लेषण करने की आवश्यकता है।
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