OT-MESH là một khuôn khổ tính toán không giám sát sử dụng vận chuyển tối ưu (OT) được điều chỉnh bởi entropy để xác định một cách có hệ thống các tương đồng tiến hóa của các loại tế bào trên khắp các loài. Để khắc phục những hạn chế của các phương pháp so khớp dựa trên tham chiếu hoặc dựa trên phép chiếu thông thường, OT-MESH cải thiện lược đồ OT bằng cách kết hợp kỹ thuật Giảm thiểu Entropy của Sinkhorn (MESH), chuyển đổi các ma trận vận chuyển khuếch tán thành các tương ứng thưa thớt có thể diễn giải được. Các đánh giá trên các tập dữ liệu tổng hợp chứng minh độ chính xác cao, hiệu quả tính toán và khả năng chống nhiễu. So với các phương pháp dựa trên OT khác, chẳng hạn như RefCM, OT-MESH đạt được độ chính xác tương đương với tốc độ được cải thiện. Các ứng dụng trên tế bào lưỡng cực võng mạc (BC) của chuột và khỉ đuôi dài và tế bào hạch võng mạc (RGC) phục hồi chính xác các mối quan hệ tiến hóa đã biết và khám phá ra các tương ứng mới, một trong số đó được xác nhận trong các thí nghiệm độc lập. Do đó, OT-MESH cung cấp một giải pháp lập bản đồ loại tế bào tiến hóa có nguyên tắc, có thể mở rộng và có thể diễn giải được, cung cấp những hiểu biết sâu sắc về sự chuyên môn hóa và bảo tồn tế bào trên khắp các loài.